La División penal es responsable de manejar todos los casos de delitos graves, apelaciones de casos penales del Tribunal Metropolitano del Condado de Bernalillo, extradiciones de delincuentes que han cometido delitos graves en otras jurisdicciones y pedidos de órdenes de arresto. Otros casos que también maneja esta división involucran casos previos a procesamiento, asuntos del Tribunal de Drogas para Adultos y la disposición de pruebas. La Oficina del actuario de la división penal es responsable de mantener un registro oficial para los casos penales. Todos los documentos de los casos penales son procesados por esta oficina.

Los casos del Tribunal civil involucran disputas entre personas, negocios o gobiernos estatales o locales. Estas disputas pueden tratarse de accidentes automovilísticos u otros tipos de accidentes, lesiones personales o daños a la propiedad, negligencia médica, incumplimiento de contrato, disputas entre caseros e inquilinos, bienes raíces u otros derechos sobre la propiedad, préstamos estudiantiles, impuestos y contravenciones u objeciones contra ordenanzas estatales o locales u otras reglamentaciones, o apelaciones de casos del Tribunal Metropolitano del Condado de Bernalillo. La Oficina del actuario de la división civil es responsable de procesar todas las demandas o peticiones nuevas, las respuestas y pedimentos subsecuentes que se presenten en esos casos, además de cobrar las tarifas correspondientes.